El órgano rector de Prodecasa es su Junta Directiva.

En Prodecasa tenemos distintas categorías de socios en función de sus características jurídicas o de dedicación:

• Profesionales
• Científicos
• Colaboradores
• Honoríficos
• Otros

Aparte de estos hay unos socios de pleno derecho que se responsabilizan de la ejecución de los programas.